百日咳杆菌是急性传染病百日咳的病原菌。
1906年，比利时细菌学家和免疫学家鲍台和让古发现，又称鲍--让杆菌。他们同时发明了百日咳杆菌菌苗。他们在研究中发现，百日咳杆菌含有对热不稳定物质，将其注入豚鼠和家兔腹腔或静脉中，能将动物杀死。如给皮下注射则产生皮肤坏死。从有病的孩子临床表现以及百日咳菌苗的副作用等均表明百日咳杆菌具有特殊的致病物质。以后许多学者从各个侧面研究百日咳杆菌的致病物，又陆续发现该菌含有多种生物学活性物质，其中有些物质与治病作用密切相关。近年来，日本、美国等许多学者已经研究制备百日咳无细胞菌苗代替全细胞菌苗，可显著减低全细胞菌苗的毒性反应。由于百日咳是一种常见的呼吸道感染病，所以应广泛地进行百日咳菌苗预防接种，一般新生儿生后三个月即可注射百日咳菌苗。由于百日咳菌苗的毒性反应使特异预防受到限制，应加速研制毒性低免疫效果好的无细胞菌苗。
