乙脑的潜伏期一般为10～14天。典型患者的病程可以分为四期。
1．初期
起病快，体温可达38℃以上。伴有头痛、恶心、呕吐、嗜睡等，小儿伴有呼吸道症状、腹泻等。
2．极期
持续高热、意识障碍、惊厥或抽搐、呼吸衰竭等。如经此期得不到恢复，病人将会死亡。乙脑病死率可达10%左右。
3．恢复期
一般在2周左右恢复，有的患者恢复慢，约需1～3个月，重症患者常需6个月才能恢复。
4．后遗症期
虽然大多数病人能够恢复，但仍有少数重症患者在发病6个月后留下神经、精神方面的后遗症，如失语、瘫痪、精神失常等。
乙脑病发初期颇似感冒，常常被误作重感冒而不加重视，延误了早期诊治。因此，在流行季节一旦出现发热、头痛等早期症状，应尽早到医院就医。只有及时发现，才能对症处理，尽快恢复，降低病死率，减少后遗症。另外，病人家属积极配合医生的诊治工作非常重要。
