预防与控制的措施主要有：
一是管理传染源。由于百日咳的传染性较强，及早发现病例并对其进行严格的呼吸道隔离措施，是控制百日咳暴发或流行的重要措施之一，隔离病例，期限为自发病起40天或出现痉咳后30天，隔离期间及时使用红霉素进行治疗者，隔离期可缩短至治疗后7天。对有密切接触史的儿童自接触之日起实施医学观察21天，如出现早期症状者立即进行隔离治疗。
二是切断传播途径。
三是保护易感者。主动免疫接种疫苗；被动免疫肌注高效价免疫球蛋白1.25ML，隔日1次，连用3－5次，可减轻症状；应急接种和药物治疗，对已有基础免疫史的5岁以下密切接触者，应立即进行DPT加强注射1针，所有不足5岁并且尚未完成基础免疫程序的密切接触者，应按最短间隔完成免疫程序规定的接种。对未免疫而又有百日咳接触史的儿童，或已感染但尚在潜伏期内，若不能实行有效的隔离，应尽快使用敏感抗菌素红霉素、氨苄青霉素进行预防性治疗，连续用药7-10天。DPT加强注射后，一般4天内可产生对百日咳杆菌抵抗力，但免疫并不是绝对的，因此，对5岁以下接触者即使已经进行了应急预防接种，也应及时给予药物进行预防性治疗。
四是加强监测。
五是做好疫情处理。
