新生儿腹泻主要在于预防。母乳是无菌的，而且母乳中有抗体尤其在初乳中抗体很多，对肠道感染有一定的抵抗力，母乳喂养可以减少腹泻发生。人工喂养时注意喂养方法和做好奶具清洁消毒，这是预防新生儿腹泻的根本措施。
一旦发生腹泻，要及时处理。如腹泻不重，由喂养不当所致，应及时调整奶量，1-2天内减少奶量或把奶稀释为1/2-2/3，但不要长时间稀释，以免婴儿营养不良。适当口服补液，可用世界卫生组织推荐的口服补液配方(医院或药店有供应)。方法如下，用1/4包加水至250毫升，按每千克体重服60毫升，在6小时内少量多次喂入。也可服妈咪爱和思米达，前者可以调整肠道正常菌群，后者有保护肠道黏膜的作用。服法：新生儿：妈咪爱每次1/3包，一日2次;思米达1/4包冲水15毫升，每日2次。两种药交替使用，间隔2小时。婴幼儿：妈咪爱1包，每天2次;思米达半包，冲水25毫升口服，每天2次。两种药交替使用，间隔2小时。以上药物比较安全，有利于腹泻康复。如腹泻较重或大便有脓血，伴有食量减少、呕吐、尿少等，应及时找医生诊治。
