典型的百日咳分为三期：
（１）初咳期。时间为七至十天。其症状与上感相似，有轻度或中度发热、流涕、咳嗽等。经过三至四天后热退，而咳嗽逐渐加重，尤以夜间重，咳嗽呈夜重日轻的趋势，若能在此期间确诊，有利于治疗。
（２）痉咳期。持续时间二至六周，也有长达十周左右。此期特点是阵发性痉挛性咳嗽，并伴有特殊的鸡鸣样吼声，发作时先是单声短促的咳嗽，连续十几声，然后一长吸气，发出一种特殊的吼声（似鸡鸣样），如此反复多次，直至将粘稠的痰液吐出为止。痉咳时患儿表情痛苦、面红耳赤、出汗，甚至嘴唇发绀。此期若无并发症，体温多为正常。
（３）恢复期。自咳嗽减轻到不咳为止，持续二至三周。
